أنشئت إدارة المتابعة منذ نشأت الجامعة في عام 1430هـ ، وهي مرتبطة مباشرة بمعالي مدير الجامعة . ومن هذا المنطلق وتحقيقاً لأهداف وسياسات الجامعة فكان من الضروري إنشاء وتفعيل إدارة المتابعة وهي تقوم بمتابعة ومراقبة الأداء لتقييم وتطبيق الأنظمة واللوائح وجميع التعليمات وتكون إدارة رقابية على أداء جميع قطاعات الجامعة وفق الأنظمة المنصوص عليها .